Plate Barcode Scanner
2次元バーコード付きラック[Thermo Scientific, Cat#3744-BR]及びそれに収納したチューブに記載されている datamatrix形式のデータを画像認識し、プレートとチューブのIDをExcel形式で出力します。
名にご利用いただき、件の画像データを処理しました。
バーコードの解析
マニュアル: plateScannerの使い方(外部リンク)
本ツールは遺伝子解析に関する検体管理を支援する目的で提供しています。 動作確認は一部のチューブとスキャナの組み合わせでしか行っておらず、また、入力ファイルにも汎用性を持たせておりません。 ご準備いただいた画像ファイルの解析では全てのバーコードが読み取り可能とは限らないというリスクを伴いますので、ご理解いただいた上でのご利用をお願いいたします。
二次元バーコードの読み取りの動作及びその精度については、チーム所有のラック9枚を標準ラックとして検証いたしております。
解析ができなかった画像をツールの改良のために利用させていただく場合がありますのでご了承ください。
  • 下記の項目を全て記入の上、画像をアップロードしてください。
  • メールアドレス
    所属
    ご入力頂いた情報は利用状況の確認のため、連結不可能匿名化のうえで保管させて頂きます。ご協力をお願い致します。
    画像ファイル選択:
    ファイルの拡張子が".jpg"又は".jpeg"の、JPEG形式の画像ファイルをのみ解析可能です。
    参考資料: 画像解析に利用しているオープンソースソフトウェアについて
    udocker
    • Jorge Gomes, Emanuele Bagnaschi, Isabel Campos, Mario David, Luís Alves, João Martins, João Pina, Alvaro López-García, Pablo Orviz, Enabling rootless Linux Containers in multi-user environments: The udocker tool, Computer Physics Communications, Available online 6 June 2018, ISSN 0010-4655, https://doi.org/10.1016/j.cpc.2018.05.021
    OpenCV
    • OpenCV (Open Source Computer Vision Library) is released under a BSD license and hence it’s free for both academic and commercial use. It has C++, Python and Java interfaces and supports Windows, Linux, Mac OS, iOS and Android. OpenCV was designed for computational efficiency and with a strong focus on real-time applications. Written in optimized C/C++, the library can take advantage of multi-core processing. Enabled with OpenCL, it can take advantage of the hardware acceleration of the underlying heterogeneous compute platform.
    libdmtx
    • libdmtx is a software library that enables programs to read and write Data Matrix barcodes of the modern ECC200 variety. The library runs natively on several platforms and can be accessed by multiple languages using the libdmtx language wrappers. The utility programs dmtxread and dmtxwrite also provide a command line interface for libdmtx, and serve as a good reference for developers writing their own libdmtx-enabled programs.