Spike-In-Detector
NGSデータに含まれるクロスコンタミネーションを検出します。
かずさDNA研究所で開発されたスパイクインDNAを封入して実施したNGSデータが対象です。
かずさDNA研究所で開発されたスパイクインDNAを封入して実施したNGSデータが対象です。
解析アプリのダウンロード
対応OS:Mac OS 10.12 or later
ユーザーガイド
本ツールはスパイクインDNA技術を利用した研究を支援する目的で提供しています。
それ以外の目的にはご使用にならないで下さい。
なお、本ツールは以下のソフトウェアを利用して開発しました。
ユーザーガイド
本ツールはスパイクインDNA技術を利用した研究を支援する目的で提供しています。
それ以外の目的にはご使用にならないで下さい。
なお、本ツールは以下のソフトウェアを利用して開発しました。
1.
FASTX Toolkit (version 0.0.13)
2. cutadapt (version 1.6)
3. Platypus (version 5.2)
Copyright (c) Sveinbjorn Thordarson All rights reserved.
4. Hexley Icon
Hexley DarwinOS Mascot Copyright (c) 2000 Jon Hooper. All Rights Reserved.
2. cutadapt (version 1.6)
3. Platypus (version 5.2)
Copyright (c) Sveinbjorn Thordarson
4. Hexley Icon
Hexley DarwinOS Mascot Copyright (c) 2000 Jon Hooper. All Rights Reserved.
出力ファイルの図表化
Spike-In-Detectorアプリの出力ファイルを図表化します。
出力ファイル(Results.txt)を選択の上、ビジュアライズ実行をクリックして下さい。
出力ファイル(Results.txt)を選択の上、ビジュアライズ実行をクリックして下さい。
参考資料
準備中